D2XやD200でも中央と周辺のAFセンサーの精度差が気になります。
ある程度絞った時はいいんですが、開放付近だと中央で合わせて
AFロックを使った方がコサイン誤差を含めても結果はいいと感じています。
（カメラを振るのではなく、平行移動すれば原理的には誤差はでないし）

この点ではD3/D300の3DトラッキングAFの御利益が大きいです。
ただ、D3の場合はAFの有効エリアが狭くなるので動体撮影においては
D300の方が使いやすいと思います。（D3でもクロップを使えばいいけど）

今まではシングルAF＋フォ−カスロックを多用していましたが、
D3では3DトラッキングAFで使うのが基本になっています。