前言撤回です。
上記のデータを実際のプリントしてブラインドテストをしたら
「ノイズの目立たなさ」ではD300＞D40＞D60＞＞D40Xという結果になりました。
ただ、画素数当たりの解像度まで考慮するとD40＝D60＞D300となり
D300は細部のデティールが消失ぎみで、バランスではD60が良好かな？
でもD300はなんとなくパンやバナナの質感が出ているように感じます。
(D40系の基準露出がオーバー目なのも影響していると思います）
このパンやバナナの質感のまとめ方や発色のバランスもD60は上手く
D300とも共通性を感じました。（D300とD60のプリントの雰囲気が似ています）

いずれにせよ、ISO1600が実用となる訳で、D2X/D200と比べると、
隔世の感がありますね。
D60も同じセンサー（と思われる）D40Xよりは確実に進化しており、
これは、キヤノンのAPS-C 800万画素機に近いモノを感じます。
D80後継がちょっと楽しみになってきました。

ISO6400のような超高感度ならともかく、通常使用なら
D3の必要性は低く、D300メインにサブでD60を併用がおススメかな？