D1xから さんの説が正しいかは分かりませんが、納得できる点があります。
一方、yさんの説明はちょっとポイントがずれている気がします。

ＡＦセンサーが距離検知できなかった時にＡＦが作動しないのは「仕様」です。
これはニコンの説明他、雑誌でもそう書かれていました。

今までと異なるので慣れが必要ですが、良い点もあります。
従来の「迷い続ける」仕様よりもＡＦセンサーが機能していないのが明確なので、
直ぐに対応をとることが出来ます。



つまりD1xから さんの説はこの現象の説明になっているのでは？
ＡＦセンサーの感知ポイント範囲が小さいため、コントラストの高い場所に合わせたつもりでも微妙に外れているということでは？
yさんが同じ場所を狙ったように思っても微妙に違っていたり、ずれていたりしてセンサーの感知ポイントに
掛かったり外れたりすることがあるのだと思います。
ニコンの回答の「センサーの特性は目視でのコントラストとも微妙に異なる」という説明にも（多少）合致します。

従来のニコンのＡＦセンサーの感知ポイントが「大きすぎたため」、感知できないことは少なかった代わりに
意図した所と別の、よりコントラストが高い所に引っ張られるのは、有名でしたよね。

新センサーになって言わば反対面での弊害ということになりますが、D1xから さんの説が本当ならかなり納得できますし、
（弊害がないに越したことはありませんが）対処法も取れるので、新センサーの方が合理的かなと思います。