CaptureNX 自体は、マルチスレッド非対応のようですから、マルチコア CPU にしても、それ自体の処理速度は変わりません。
ただしパソコンが動作しているときは、OS 関連のプロセスだけでも数十個動作しているので、マルチコア CPU の効果はかなりあります。
私の実験では、2.66GHz の Celeron から、2.8GHz の Pentium4(HT) に変えたら、バッチ処理が3割ほど短くなりました。何よりも、処理中にマウスやキーボード操作がギクシャクしなくなったのがいいです。
もっとも、その後 Core2Duo 3GHz(E8400) に変えたら、さらに5割以上短縮されましたが。