D700のメリットはFXフォ−マットであるという事
それをD3よりも安価に楽しめるという事

今はこの2つだと思いますよ。
個人的にはDXフォーマットで写真を撮る事に違和感があったほうなので、D700でFXフォーマットで写真が撮れることに何も疑問はありません。
高感度の有利性とか望遠効果の不利とか、不利有利を上げていったらキリありませんよ。50mmレンズは50mmとして使え、28mmレンズを28mmとして使う、
それだけで十分だと思っています。ただ、使う方の撮影スタイルや環境、使用方法がさまざまなので、感じ方も変わってきますから、
何か「ほんとう」でなにが「間違ってる」のかはご自分が見て確認するのがいいと思います。あんまし他人の言う事に左右されずに
自分の撮影スタイルに合ったカメラを選んだほうがよいかと・・・あくまでも他人の意見や雑誌の評価は「参考までに」見ておいたほうが・・・