さすがにそれはないでしょう。カメラの中は完全にデジタル化しているとしか考えられないのですが。
内部処理はほぼ間違いなく RGB (D300 の場合は原色フィルタのはずなので) で最終的な画像出力部分だけをチップで変換しているはずです。
デジタル信号である RGB をアナログ信号である NTSC に変換した後に、今度はそれを Y/C分離して、各画素の RGB を抽出してそれをコントラストAFの元データにするということは内部処理が複雑になりますし、NTSC は走査線が525本しかないのでコントラストAFの精度が落ちるでしょう。

コントラストAFの処理はアナログ回路を使用した処理ではないと思います。

D300 には HDMI 出力もありますが、これは PCモニタで使われる DVI のサブセット、つまりデジタルRGB出力です。この信号は一度変換した NTSC から作られるわけではないと思います。
解像度がNTSC程度になりますし、デジタル→アナログ→デジタル、となり処理が複雑になりますので。