それはもちろん、「携帯性」の向上でしょう。

24mm〜50mmのフィルター径52mmの単焦点レンズは、
デジタル時代の大型化したボディには、ちょっと小さすぎてバランスが悪いというのは、多くの人が感じるところだと思います。
また、デジタル時代に要求される解像力や周辺画質を確保するためにも、
多少大きめに再設計するというのは、当然な流れでしょう。

一方、だからといって不必要に大きくする意味はなく、
フィルム時代の規格に合わせて設計するというのは、
ニコンの技術者からすれば、本末転倒なのかもしれませんし、
58mmが「必要十分」な大きさとニコンは判断したのだと想像します。
また、「携帯性」を重視したいわたし個人としては、
62mmの方が便利かな？という気持ちはもちろんありますけど、
あえて62mmよりひと回り小さくしたところに、共感する部分もあります。
フィルター径は、レンズ全体の大きさや重量に影響することでしょうから。

縦グリなしのFXボディの大きさは、
おそらくD700あたりが標準的になっていくと予想され、
ならば、従来の規格にとらわれず、それにジャストフィットする大きさにデザインし直すというのは、
合理的なんではないでしょうか？
DXのコンパクトズームの場合も、
最初67mmが登場したときは、違和感がありましたが、
D300クラスのボディにはジャストフィットだと感じています。

まあ、これまでのレンズ資産と併用するには明らかに使いづらく、
たしかに意見の分かれるところではありますね。
ニコンとしては、いままでの52mmの単焦点は58mmに変えるので、
「それでそろえてね」ってことなんでしょう。