画像をお見せいただかないと何とも言えませんが、おそらくは
手ブレが原因だと思います。

ピンボケの場合、目的物にピンが来ていなくても、
画面内のどこかにピンの来ている場所があるはずです。

それが存在せず、全体が甘いとしたら、手ブレの可能性が一番
考えられる原因です。

どのような状況で、どのような姿勢、カメラレンズの保持状態で
撮影されたのか、ＳＳはどれくらいかなどのデーターも書いて
いただければと思います。

あと、ピクセル等倍とかでピントチェックしていませんか？
ここいら辺の鑑賞スタイルとかも書いていただけるとより良い
アドバイスがあると思いますが。