必ずしも純正が良いというわけではないにせよ、レンズによって描写は違います。
ただそれを言葉で説明するのは難しいし、人によって重んじるポイントが違いますので良い悪いと簡単には言い切れません。
歪曲収差（歪み）を気にする人、色収差を気にする人、ぼけ味を重んじる人、シャープさ命の人、などなど。
この辺、好み以前に被写体や撮り方から来る違いも大きいのだと思います。

レンズの仕様のうち焦点距離や開放Ｆ値は基本ですが、最短焦点距離（どこまで寄れるか）とか絞り羽根枚数・形状とか最小絞り（開放Ｆ値と逆にどこまで絞れるか）など、用途次第でとても重要になってくる仕様の差もあります。
また私の場合は、日常的にはマニュアルフォーカスばかり使っていますので、ピントリングの回転方向・回転幅・トルク感などが、レンズ選びのときとても重要なポイントになります。

ちなみに、ニコン純正とピントリングの回転方向が逆なので（混乱するので）、私は SIGMA・TAMRON 追放運動中！
あと４本 (^o^;;