一番大きな違いはD3やフィルム一眼レフで使えるかどうかでしょう。
17-50mmのほうはAPS-Cデジ一専用ですよね。
それから、レンズの逆さ付けをして超マクロ撮影する場合、17-35mmのほうは絞り環がありますから絞りを変えられますが、17-50mmでは最小絞り固定になってしまいます。BR-6を使えばある程度絞りを制御できますが。