D7000を水没させてダメにしてかわりにとV1を購入したところ純正の28−300ズームは快適に800mm相当で使用できましたが50−500で1000mm超と期待していたところレンズが付いていないとの画面が出て使用出来ませんでした。なぜなんでしょう？

私の経験ではシグマレンズはEFマウントではあんまり問題が出ないのですがFマウントではいろいろソフトをいじっているらしくシグマが動作確認したレンズ以外では動作しないものが多いようです。
とりあえずシグマに報告してみましょう。すぐには対応してくれないとは思いますが対応してくれるかもしれません。
50-500はF6.3だから本来はAFできないところをできるようにしてしまっているので、もしかするとこれから出るボディでも問題が起こるかもしれません。