みず＠さん、はじめまして。。

SIGMAの70-200mmの後ピンについてですが、１月に私が良く顔を出すBBSの仲間も
同様の不具合をレポートしてました。
その方は、ボディはD200でAFで駄目だったそうですよ。

買われてすぐにわかったそうですが、販売店での交換はせずSIGMAへ送って調整
してもらったそうです。（レンズのみ送付）

数週間前に調整が完了して、戻ってきましたが、完璧な調整がされているようでした。

みず＠さんの場合も、同様な症状のように思います。
まずは、普通にSIGMAに電話されて、相談されてはいかがでしょう。
たぶんこれでOKだと思いますよ。
もし、駄目な時は私も仲間に詳しく聞いて見ますよ。